Monographien
- Der versöhnte Versöhner. Paulus als unentbehrlicher Mittler im Heilsvorgang zwischen Gott und Gemeinde nach 2 Kor 2,14-7,4 (TANZ 10), Tübingen: Francke Verlag, 1993.
- Erinnerung an Jesu Worte. Studien zur Rezeption der Logienüberlieferung in Markus, Q und Thomas (WMANT 76), Neukirchen-Vluyn: Neukirchener Verlag, 1997.
- Jesus und die Anfänge der Christologie. Methodologische und exegetische Studien zu den Ursprüngen des christlichen Glaubens (BThS 47), Neukirchen-Vluyn: Neukirchener Verlag, 2001.
- Das Abendmahl. Frühchristliche Deutungen und Impulse für die Gegenwart (SBS 210), Stuttgart: Katholisches Bibelwerk, 2006.
- Jesus von Nazareth. Jude aus Galiläa - Retter der Welt (Biblische Gestalten 15), Leipzig: Evangelische Verlagsanstalt, 2006; 6. vollständig überarbeitete und aktualisierte Auflage 2017.
- Englische Übersetzung: Jesus of Nazareth. Jew from Galilee - Savior of the World, translated by Wayne Coppins, Waco (TX): Baylor University Press, 2014.
- Französische Übersetzung: Jésus de Nazareth. A la recherche de l'homme de Galilée, Genf: Labor et Fides, 2018.
- Von Jesus zum Neuen Testament. Studien zur urchristlichen Theologiegeschichte und zur Entstehung des neutestamentlichen Kanons (WUNT 204), Tübingen 2007.
- Englische Übersetzung: From Jesus to the New Testament. Early Christian Theology and the Origin of the New Testament Canon, translated by Wayne Coppins (Baylor-Mohr Siebeck Studies in Early Christianity), Waco (TX)/Tübingen 2013.
- Nehmt, esst und trinkt. Das Abendmahl verstehen und feiern, Stuttgart: Katholisches Bibelwerk, 2010.
- Die Entstehung der Bibel. Von den ersten Texten zu den heiligen Schriften (gemeinsam mit Konrad Schmid), München: C.H. Beck, 2019, 3. Auflage 2020, 1. durchgesehene Auflage in C.H. Beck Paperback 2022.
- Englische Übersetzung: The Making of the Bible. From the First Fragments to Sacred Scripture, Cambridge, MA/London, UK: Harvard University Press, 2021, Paperback 2023.
- Französische Übersetzung: Aux origines de la Bible. Des premiers textes aux saintes Écritures, Genève: Labor et Fides, 2021.
- Portugiesische Übersetzung: O surgimento da Bíblia. Dos primeiros textos às Sagradas Escrituras, Petrópolis: Editora Vozes/São Leopoldo, Rs: Editora Sinodal, 2023.
- Italienische Übersetzung: La Formazione della Bibbia. Dai primi testi alle Sacre Scritture (Editrice Morcelliana), Brescia 2024.
- Die apokryphen Evangelien. Jesusüberlieferungen außerhalb der Bibel, München: C.H. Beck, 2020; 2. Auflage 2024.
- Englische Übersetzung: The Apocryphal Gospels. Jesus Traditions outside the Bible (Early Christian Apocrypha 9), Eugene, OR: Cascade Books, 2021.
- Französische Übersetzung: Les Évanglies Apocryphes. Jésus en dehors de la Bible, Genève: Labor et Fides, 2022.
- Jesus. Leben und Wirkung, München: C.H. Beck, 2020.
- Die Entstehung des Christentums. Von den Anfängen bis zu Konstantin dem Großen, München: C.H. Beck, 2024.
- Arbeitsbuch zum Neuen Testament (gemeinsam mit Andreas Lindemann und Konrad Schwarz), Tübingen: Mohr Siebeck, 2024.